Laboratorium Filtracji Aerozoli (AEROFIL)
Laboratorium Filtracji Wody, Paliw Ciekłych i Gazów Procesowych
Zespół Badawczy Aerozoli i Inhalatorów (RESPI-LAB)
Zespół Badawczy Membran i Procesów Membranowych
Laboratorium Inżynierii Biomedycznej (BioMedLab)
Laboratorium Inżynierii Powierzchni i Protez Naczyniowych (BioGraftLab)
Laboratorium Otrzymywania i Funkcjonalizacji Nanohydroksyapatytu (LabOFn)
Zespół Badawczy Bioreaktorów Single-Use (SU-BIOreaktor)
Zespół Badawczy ds. Przetwarzania Biomasy Lignocelulozowej
Zespół Badawczy Nanodyspersji Gazów w Cieczach
Laboratorium Płynów w Stanie Nadkrytycznym (SCF-LAB)
Zespół Badawczy Inżynierii Reaktorów Chemicznych
Zespół Badawczy Wielofunkcyjnych Układów Emulsyjnych i Cieczy Wysokolepkich